Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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