Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ddx28Q9CWT6 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ddx28Q9CWT6 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ddx28Q9CWT6 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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