Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ8

4930519P11Rik, RIKEN cDNA 4930519P11 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519P11RikQ9CUJ8 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms