Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Lhfpl3Q9CTN8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms