Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms