Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM1

Type III endosome membrane protein TEMP, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQM1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQM1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQM1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQM1 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQM1 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQM1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQM1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQM1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQM1 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQM1 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQM1 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQM1 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQM1 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQM1 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQM1 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQM1 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQM1 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQM1 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQM1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQM1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQM1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQM1 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQM1 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQM1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQM1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQM1 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQM1 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQM1 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQM1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQM1 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQM1 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQM1 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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