Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl35Q9CQL6 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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