Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms