Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms