Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms