Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp2Q9CQ73 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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