Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Use1Q9CQ56 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms