Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms