Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms