Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Hdac9Q99N13 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Hdac9Q99N13 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Hdac9Q99N13 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Hdac9Q99N13 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Hdac9Q99N13 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Hdac9Q99N13 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Hdac9Q99N13 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Hdac9Q99N13 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Hdac9Q99N13 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Hdac9Q99N13 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Hdac9Q99N13 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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