Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Sh3bp5lQ99LH9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp5lQ99LH9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp5lQ99LH9 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp5lQ99LH9 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Sh3bp5lQ99LH9 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Sh3bp5lQ99LH9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Sh3bp5lQ99LH9 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp5lQ99LH9 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Sh3bp5lQ99LH9 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Sh3bp5lQ99LH9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Sh3bp5lQ99LH9 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Sh3bp5lQ99LH9 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp5lQ99LH9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp5lQ99LH9 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp5lQ99LH9 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Sh3bp5lQ99LH9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3bp5lQ99LH9 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3bp5lQ99LH9 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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