Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms