Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Vmp1Q99KU0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Vmp1Q99KU0 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmp1Q99KU0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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