Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms