Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms