Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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Pacsin3Q99JB8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pacsin3Q99JB8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms