Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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