Protein–RNA interactions for Protein: Q91Z38

Ttc1, Tetratricopeptide repeat protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc1Q91Z38 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ttc1Q91Z38 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ttc1Q91Z38 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc1Q91Z38 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc1Q91Z38 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc1Q91Z38 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc1Q91Z38 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc1Q91Z38 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc1Q91Z38 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc1Q91Z38 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc1Q91Z38 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc1Q91Z38 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc1Q91Z38 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ttc1Q91Z38 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc1Q91Z38 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ttc1Q91Z38 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ttc1Q91Z38 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc1Q91Z38 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc1Q91Z38 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc1Q91Z38 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc1Q91Z38 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc1Q91Z38 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc1Q91Z38 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc1Q91Z38 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc1Q91Z38 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc1Q91Z38 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc1Q91Z38 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc1Q91Z38 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc1Q91Z38 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc1Q91Z38 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc1Q91Z38 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc1Q91Z38 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc1Q91Z38 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc1Q91Z38 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc1Q91Z38 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc1Q91Z38 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ttc1Q91Z38 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc1Q91Z38 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc1Q91Z38 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc1Q91Z38 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc1Q91Z38 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc1Q91Z38 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc1Q91Z38 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms