Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf6Q91YR7 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms