Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms