Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Usp3Q91W36 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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