Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps3Q91VB4 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms