Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCZ8

Rpusd1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd1Q8VCZ8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd1Q8VCZ8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Rpusd1Q8VCZ8 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rpusd1Q8VCZ8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rpusd1Q8VCZ8 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd1Q8VCZ8 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd1Q8VCZ8 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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Rpusd1Q8VCZ8 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd1Q8VCZ8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd1Q8VCZ8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd1Q8VCZ8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd1Q8VCZ8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd1Q8VCZ8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd1Q8VCZ8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd1Q8VCZ8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd1Q8VCZ8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd1Q8VCZ8 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd1Q8VCZ8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd1Q8VCZ8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd1Q8VCZ8 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd1Q8VCZ8 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd1Q8VCZ8 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd1Q8VCZ8 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd1Q8VCZ8 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd1Q8VCZ8 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd1Q8VCZ8 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd1Q8VCZ8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd1Q8VCZ8 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd1Q8VCZ8 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd1Q8VCZ8 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd1Q8VCZ8 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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