Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms