Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssh3Q8K330 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms