Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms