Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms