Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Upp2Q8CGR7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Upp2Q8CGR7 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms