Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms