Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms