Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms