Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE33

Klhl11, Kelch-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl11Q8CE33 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl11Q8CE33 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl11Q8CE33 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl11Q8CE33 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl11Q8CE33 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl11Q8CE33 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl11Q8CE33 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl11Q8CE33 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl11Q8CE33 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl11Q8CE33 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl11Q8CE33 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl11Q8CE33 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl11Q8CE33 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl11Q8CE33 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl11Q8CE33 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl11Q8CE33 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl11Q8CE33 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl11Q8CE33 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl11Q8CE33 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl11Q8CE33 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl11Q8CE33 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl11Q8CE33 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl11Q8CE33 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl11Q8CE33 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl11Q8CE33 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl11Q8CE33 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl11Q8CE33 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl11Q8CE33 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl11Q8CE33 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl11Q8CE33 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl11Q8CE33 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl11Q8CE33 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl11Q8CE33 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl11Q8CE33 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl11Q8CE33 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl11Q8CE33 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms