Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDI7

Ccdc150, Coiled-coil domain-containing protein 150, mousemouse

Predictions only

Length 1,110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc150Q8CDI7 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc150Q8CDI7 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc150Q8CDI7 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc150Q8CDI7 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc150Q8CDI7 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc150Q8CDI7 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc150Q8CDI7 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc150Q8CDI7 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc150Q8CDI7 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc150Q8CDI7 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc150Q8CDI7 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc150Q8CDI7 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc150Q8CDI7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc150Q8CDI7 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc150Q8CDI7 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc150Q8CDI7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc150Q8CDI7 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc150Q8CDI7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc150Q8CDI7 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc150Q8CDI7 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc150Q8CDI7 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc150Q8CDI7 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc150Q8CDI7 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc150Q8CDI7 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc150Q8CDI7 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms