Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC96

Uncharacterized protein C6orf222 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CC96 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8CC96 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8CC96 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8CC96 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8CC96 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8CC96 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8CC96 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8CC96 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8CC96 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8CC96 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8CC96 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8CC96 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8CC96 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8CC96 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8CC96 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8CC96 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8CC96 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8CC96 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8CC96 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8CC96 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8CC96 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8CC96 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8CC96 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8CC96 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8CC96 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8CC96 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8CC96 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8CC96 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8CC96 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8CC96 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8CC96 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8CC96 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8CC96 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8CC96 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8CC96 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8CC96 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8CC96 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8CC96 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8CC96 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8CC96 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8CC96 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8CC96 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8CC96 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8CC96 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8CC96 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8CC96 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8CC96 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8CC96 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8CC96 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8CC96 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8CC96 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8CC96 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8CC96 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8CC96 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8CC96 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8CC96 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8CC96 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8CC96 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8CC96 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8CC96 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8CC96 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8CC96 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8CC96 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8CC96 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Q8CC96 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8CC96 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8CC96 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8CC96 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8CC96 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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Q8CC96 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Q8CC96 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8CC96 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8CC96 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8CC96 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8CC96 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8CC96 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8CC96 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Q8CC96 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8CC96 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8CC96 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8CC96 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8CC96 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8CC96 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8CC96 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8CC96 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8CC96 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8CC96 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8CC96 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8CC96 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8CC96 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8CC96 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8CC96 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8CC96 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms