Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ephb1Q8CBF3 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms