Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Slfn5Q8CBA2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Slfn5Q8CBA2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Slfn5Q8CBA2 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Slfn5Q8CBA2 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Slfn5Q8CBA2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Slfn5Q8CBA2 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Slfn5Q8CBA2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Slfn5Q8CBA2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Slfn5Q8CBA2 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Slfn5Q8CBA2 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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Slfn5Q8CBA2 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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