Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rbbp5Q8BX09 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbbp5Q8BX09 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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