Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Usp38Q8BW70 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Usp38Q8BW70 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Usp38Q8BW70 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Usp38Q8BW70 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Usp38Q8BW70 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Usp38Q8BW70 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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