Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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