Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
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Pggt1bQ8BUY9 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
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Pggt1bQ8BUY9 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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Pggt1bQ8BUY9 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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Pggt1bQ8BUY9 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
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Pggt1bQ8BUY9 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Pggt1bQ8BUY9 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Pggt1bQ8BUY9 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Pggt1bQ8BUY9 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Pggt1bQ8BUY9 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14□□□□□ -0.17
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Pggt1bQ8BUY9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pggt1bQ8BUY9 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Pggt1bQ8BUY9 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms