Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
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Gga3Q8BMI3 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gga3Q8BMI3 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gga3Q8BMI3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gga3Q8BMI3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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