Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms