Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms