Protein–RNA interactions for Protein: Q80YA8

Crb2, Protein crumbs homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crb2Q80YA8 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crb2Q80YA8 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Crb2Q80YA8 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Crb2Q80YA8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Crb2Q80YA8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Crb2Q80YA8 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Crb2Q80YA8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Crb2Q80YA8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crb2Q80YA8 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crb2Q80YA8 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Crb2Q80YA8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crb2Q80YA8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crb2Q80YA8 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crb2Q80YA8 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crb2Q80YA8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crb2Q80YA8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crb2Q80YA8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crb2Q80YA8 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crb2Q80YA8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crb2Q80YA8 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Crb2Q80YA8 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crb2Q80YA8 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Crb2Q80YA8 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Crb2Q80YA8 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crb2Q80YA8 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Crb2Q80YA8 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crb2Q80YA8 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crb2Q80YA8 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Crb2Q80YA8 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Crb2Q80YA8 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crb2Q80YA8 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Crb2Q80YA8 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crb2Q80YA8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crb2Q80YA8 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crb2Q80YA8 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crb2Q80YA8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms