Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW7

Akna, AT-hook-containing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AknaQ80VW7 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms